Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms