Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms