Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTCFP49711 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTCFP49711 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTCFP49711 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTCFP49711 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTCFP49711 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTCFP49711 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTCFP49711 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTCFP49711 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTCFP49711 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTCFP49711 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTCFP49711 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTCFP49711 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTCFP49711 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms