Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP4P49662 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP4P49662 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP4P49662 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP4P49662 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP4P49662 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP4P49662 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP4P49662 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms