Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPFP49454 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPFP49454 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPFP49454 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPFP49454 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPFP49454 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPFP49454 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPFP49454 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPFP49454 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPFP49454 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms