Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms