Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LMAN1P49257 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms