Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF4P48230 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms