Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME1P48163 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME1P48163 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME1P48163 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ME1P48163 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME1P48163 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME1P48163 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME1P48163 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms