Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms