Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RANGAP1P46060 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RANGAP1P46060 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RANGAP1P46060 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RANGAP1P46060 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms