Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MCAMP43121 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCAMP43121 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MCAMP43121 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCAMP43121 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCAMP43121 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCAMP43121 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms