Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms