Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA1P42261 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA1P42261 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA1P42261 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA1P42261 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA1P42261 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA1P42261 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms