Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms