Protein–RNA interactions for Protein: P40463

VHS2, Protein VHS2, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS2P40463 YCL019WYCL019W 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
VHS2P40463 VPS38YLR360W 1320 nt2.87□□□□□ -1.95
VHS2P40463 FAR8YMR029C 1572 nt2.87□□□□□ -1.95
VHS2P40463 XRS2YDR369C 2565 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 VAS1YGR094W 3315 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 MED1YPR070W 1701 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RAV2YDR202C 1056 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 STE2YFL026W 1296 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 CDC26YFR036W 375 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 SOP4YJL192C 705 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 YPL142CYPL142C 318 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 MRPL40YPL173W 894 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RXT2YBR095C 1293 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 SHG1YBR258C 429 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 YKL100CYKL100C 1764 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RRP5YMR229C 5190 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 STE23YLR389C 3084 nt2.86□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RIM13YMR154C 2184 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 MSR1YHR091C 1932 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 MDN1YLR106C 14733 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 CDC37YDR168W 1521 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 URK1YNR012W 1506 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 snR83snR83 306 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 YHL044WYHL044W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RPS21BYJL136C 264 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 ERG20YJL167W 1059 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 UTP11YKL099C 753 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 VMA6YLR447C 1038 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 PDS5YMR076C 3834 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RIB4YOL143C 510 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 SME1YOR159C 285 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 TIM12YBR091C 330 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 MED8YBR193C 672 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 YCK2YNL154C 1641 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 TCB3YML072C 4638 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 NSA1YGL111W 1392 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 RAD26YJR035W 3258 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 AVT2YEL064C 1443 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS2P40463 BRE5YNR051C 1548 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 NOG1YPL093W 1944 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 POL2YNL262W 6669 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 NSE4YDL105W 1209 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 UBC13YDR092W 462 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 YGL152CYGL152C 678 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 IGO2YHR132W-A 396 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 GRE2YOL151W 1029 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 PDC2YDR081C 2778 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS2P40463 KRE2YDR483W 1329 nt2.84□□□□□ -1.96
VHS2P40463 RTT109YLL002W 1311 nt2.84□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ROD1YOR018W 2514 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 TCP1YDR212W 1680 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 URA2YJL130C 6645 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 TRX3YCR083W 384 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YGR115CYGR115C 780 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 DAD2YKR083C 402 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 GIM5YML094W 492 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YNL043CYNL043C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 RRG7YOR305W 729 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 RPL19AYBR084C-A 570 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 NET1YJL076W 3570 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 SLK19YOR195W 2466 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 AI2Q0055 2565 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 RAD18YCR066W 1464 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 SOK1YDR006C 2706 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 VHR2YER064C 1518 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ALA1YOR335C 2877 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 OSH3YHR073W 2991 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 MAK21YDR060W 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YLR352WYLR352W 2424 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 SEC53YFL045C 765 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 LST7YGR057C 729 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YJR020WYJR020W 333 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ANB1YJR047C 474 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 MCR1YKL150W 909 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 CDC123YLR215C 1083 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 PRP31YGR091W 1485 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 PPQ1YPL179W 1650 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 JJJ2YJL162C 1752 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS2P40463 FLO1YAR050W 4614 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YAT2YER024W 2772 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 LOC1YFR001W 615 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YGR283CYGR283C 1026 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 LIN1YHR156C 1023 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ATG27YJL178C 816 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YLR257WYLR257W 966 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 URA5YML106W 681 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ATX1YNL259C 222 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ATP11YNL315C 957 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 RPL20BYOR312C 519 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 FDH1YOR388C 1131 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 RET3YPL010W 570 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ATP20YPR020W 348 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 ANR2YKL047W 1551 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 YNL193WYNL193W 1677 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 APE2YKL157W 2859 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS2P40463 SRB4YER022W 2064 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS2P40463 CDC45YLR103C 1953 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms