Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms