Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN7P35236 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms