Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSP1P33241 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSP1P33241 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSP1P33241 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSP1P33241 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSP1P33241 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSP1P33241 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSP1P33241 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSP1P33241 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSP1P33241 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSP1P33241 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSP1P33241 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSP1P33241 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSP1P33241 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSP1P33241 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSP1P33241 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSP1P33241 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSP1P33241 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSP1P33241 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms