Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC13P31276 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC13P31276 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms