Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms