Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD34P28906 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD34P28906 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD34P28906 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms