Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms