Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX2P28328 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX2P28328 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX2P28328 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX2P28328 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms