Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms