Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN3P26045 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN3P26045 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms