Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRM1P23921 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM1P23921 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM1P23921 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RRM1P23921 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM1P23921 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM1P23921 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM1P23921 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM1P23921 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms