Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP100P23497 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP100P23497 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP100P23497 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SP100P23497 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP100P23497 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP100P23497 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP100P23497 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP100P23497 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms