Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLDCP23378 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLDCP23378 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLDCP23378 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLDCP23378 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLDCP23378 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLDCP23378 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GLDCP23378 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms