Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTF3P20783 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms