Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF6P18850 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6P18850 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms