Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XBP1P17861 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XBP1P17861 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XBP1P17861 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XBP1P17861 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XBP1P17861 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XBP1P17861 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XBP1P17861 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XBP1P17861 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms