Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB4P16144 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms