Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCP1P13796 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCP1P13796 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCP1P13796 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCP1P13796 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCP1P13796 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCP1P13796 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCP1P13796 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms