Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG2P13521 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG2P13521 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG2P13521 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG2P13521 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG2P13521 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCG2P13521 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG2P13521 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms