Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMP3P12645 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMP3P12645 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMP3P12645 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMP3P12645 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BMP3P12645 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMP3P12645 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms