Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARBP10826 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARBP10826 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARBP10826 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARBP10826 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARBP10826 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARBP10826 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARBP10826 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARBP10826 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARBP10826 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARBP10826 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RARBP10826 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARBP10826 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RARBP10826 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARBP10826 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARBP10826 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms