Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI3P10071 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI3P10071 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI3P10071 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI3P10071 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI3P10071 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI3P10071 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI3P10071 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms