Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALM2P0DP24 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALM2P0DP24 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms