Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2MP0CAP2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms