Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms