Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB1P08034 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB1P08034 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB1P08034 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB1P08034 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB1P08034 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB1P08034 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB1P08034 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB1P08034 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB1P08034 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms