Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALB1P05937 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALB1P05937 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALB1P05937 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALB1P05937 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALB1P05937 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALB1P05937 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALB1P05937 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALB1P05937 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALB1P05937 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALB1P05937 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms