Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPN1P04843 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPN1P04843 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPN1P04843 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPN1P04843 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms