Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOEP02649 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOEP02649 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOEP02649 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOEP02649 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOEP02649 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOEP02649 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOEP02649 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOEP02649 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms