Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL2A1P02458 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL2A1P02458 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms