Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms