Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P00740 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F9P00740 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F9P00740 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F9P00740 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
F9P00740 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
F9P00740 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
F9P00740 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
F9P00740 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F9P00740 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F9P00740 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F9P00740 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F9P00740 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F9P00740 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F9P00740 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F9P00740 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F9P00740 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms