Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms