Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR4O95473 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms